La Terminal de San Juan fue inaugurada el 17 de diciembre de 1973, reemplazando a la antigua estación, y se ha mantenido como un nodo central del transporte interprovincial y nacional. Tras su inauguración, fue objeto de remodelaciones significativas en 2019 para modernizar sus instalaciones.
La antigua terminal estuvo instalada en el centro de San Juan donde el ingreso de las unidades era por calle Mendoza antes de Libertador y la salida era sobre calle General Acha, pasando Avenida Libertador.