1940
Informe sobre importancia paleontológica de
Ischigualasto. Se empieza a producir en forma industrial el aceite de oliva. En la década del 40 cambia el tipo de inmigración, ya casi no hay inmigrantes de origen árabe y disminuyen las otras etnias.
1941
Inauguración del antiguo Palacio Municipal.
1942
Se llamó a elecciones para cubrir el gobierno en el período comprendido entre 1942 y 1946, fue elegida la fórmula Pedro Valenzuela – Horacio Videla, ambos con trayectoria en la docencia. No lograron cubrir su mandato, sólo gobernaron pocos meses porque fueron depuestos.
1943
Creación del Banco de San Juan como institución mixta. El 4 de junio se lleva a cabo el golpe de estado que depuso al corto gobierno de Valenzuela – Videla.
1944
El 15 de enero un
terremoto sacudió a
San Juan, los sanjuaninos se preocuparon sólo por sobrevivir y reconstruir en esa época. El reloj de la Catedral quedó detenido a la hora fatídica, las 20.49. El 90% de las viviendas quedaron destruidas, se habla de 10 mil muertos y entre 10 y 20 mil heridos.
1945
Creación en San Juan del Partido Laborista, que llevó a Perón a la presidencia.
1946
Creación de la CLANCAY, en
Jáchal. Cantoni disuelve el Partido Bloquista. En febrero se llevaron a cabo elecciones que en el orden nacional dieron como ganador a Juan Domingo perón, en la provincia ganó el binomio Juan Luis Alvarado - Ruperto Godoy. En mayo asumió el nuevo gobierno que se caracterizó por tener poco tacto político.
1947
Se crea la Facultad de Ingeniería, Ciencias Exactas y Natural dependiente de la U.N. Cuyo. Creación del Consejo de Protección de la Producción Agrícola. Fundación de Diario de Cuyo. Se realiza el Censo Nacional. Renuncia el gobernador Luis Alvarado.
1949
Reforma Constitución Provincial peronista.